Первые попытки объединения профессоров г. Томска были предприняты в 1905 г., когда в городе было создано отделение Академического союза — общественной организации российского масштаба. Согласно принятому уставу, в компетенцию Томского отделения входили не только вопросы жизни и деятельности томской профессуры, но и проблемы общественного, сословного, политического, национального характера. Номинально организация просуществовала до 1918 г., но из-за левых взглядов ее членов, которые не устраивали царское правительство, период активной деятельности продолжался только до 1907 г.
Общее собрание профессоров Томска и Северска 9 февраля 2007 г. поддержало инициативу Губернатора Томской области В.М. Кресса по возрождению традиций Томской профессуры — создать общественное объединение профессоров «Томское профессорское собрание» (ТПС). Избранный на собрании оргкомитет в составе 23 профессоров подготовил проект Устава ТПС и другие учредительные документы. На конференции 26 июня 2007 г. был утвержден Устав и избраны правление и ревизионная комиссия. 7 декабря 2007 г. ТПС зарегистрировано в юридических органах как некоммерческая региональная общественная организация. В ноябре 2007 г. начато создание девяти первичных организаций ТПС: в шести университетах, в ТНЦ СО РАН, ТНЦ СО РАМН и в г. Северске.
